Home | | Mapa strony


PRACOWNIA EPIGENETYKI

Dane kontaktowe Baza badawcza Opis badań

Program badawczy

Aktualnie prowadzone są badania nad zmiennością genetyczną białek chromatynowych, głównie histonu H1, na poziomie białka z zastosowaniem różnych metod elektroforezy w żelu poliakrylamidowym oraz, we współpracy z innymi ośrodkami naukowymi, z wykorzystaniem metod spektrometrii mas i mikrosekwencjonowania specyficznych peptydów.

Planujemy przeprowadzenie analiz genetycznych na poziomie DNA i genów, dzięki temu zostanie poznana zmienność (także zmienność utajona) genów histonu H1, histonów nukleosomalnych i innych białek chromatynowych (enzymy, białka regulatorowe, strukturalne białka niehistonowe) u ptaków celem określenia tendencji mikroewolucyjnych wśród białek chromatynowych.
Ponadto będą poszukiwane nowe warianty histonu H1 i histonów nukleosomalnych u ptaków oraz przeprowadzone zostaną analizy potranslacyjnymi modyfikacji histonów nukleosomalnych i histonu H1 (acetylacja, fosforylacja, metylacja, ubikwitynacja i inne) w różnych populacjach ptaków domowych celem ustalenia populacyjnego zróżnicowania modyfikacji epigenetycznych. Zostaną także podjęte próby odkrycia u ptaków pewnych zjawisk epigenetycznych występujących w innych taksonach, takich jak np. piętno genomowe u ssaków łożyskowych i roślin nasiennych bądź paramutacje spotykane czasem u roślin i niezwykle rzadko u ssaków.
W dalszej perspektywie planowane są również badania z zakresu inżynierii genetycznej i metabolicznej roślin energetycznych celem transformacji metabolizmu przedstawicieli wybranej grupy roślin (grzyby, glony bądź rośliny wyższe) w kierunku wykorzystania w procesach technologicznych związanych z przemianą biomasy w bioenergię, biopaliwa, bądź biomateriały.

Współpraca naukowo-badawcza

  1. Krajowa:
    • Instytut Biochemii i Biofizyki PAN w Warszawie
    • Uniwersytet Jagielloński w Krakowie
    • Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie
    • Instytut Zootechniki w Balicach – Państwowy Instytut Badawczy
  2. Zagraniczna:


Realizowane projekty badawcze
Aktualnie prowadzimy badania naukowe w zakresie zbiorczego wieloletniego tematu pt. "Naturalne mutacje histonu H1 ptaków" , które są finansowane w wysokości ok. 25000 zł rocznie w ramach badań statutowych i własnych pracowników naukowo-dydaktycznych Zakładu Biochemii i Genetyki (prof. Jan Pałyga i dr Andrzej Kowalski). W najbliższym czasie zamierzam złożyć wniosek o grant ministerialny.

English version:


Research

Our laboratory is currently conducting investigations on the genetic variability of chromatin proteins, mainly histone H1, at the level of protein by using a variety of electrophoretic techniques in the polyacrylamide gel followed by, in cooperation with other research institutions, mass spectrometry and microsequencing of specific peptides presumably harboring mutations in histone H1.

Now, we are planning to perform genotyping in order to find a variability (including cryptic variation) within the genes (and other DNA fragments of interest) for histone H1, nucleosomal histones and other chromatin proteins (structural nonhistone proteins, enzymes, regulatory proteins, etc.) to assess microevolutionary trends within avian chromatin proteins.

Moreover, we expect to find new variants of histone H1 and nucleosomal proteins in birds as well as the patterns of posttranslational modifications of linker and nucleosomal histones (acetylation, phosphorylation, methylation, ubiqitination and others) in various populations of domestic birds to evaluate variation of epigenetic modifications within population. An effort will also be put into finding a possible characteristic epigenetic phenomena occurring in other taxons, such as paramution in plants and occasionally in mammals or genomic imprinting in eutherians and flower plants.

In future, we are going to engage in a research in the field of genetic and metabolic engineering aiming at altering a metabolism in a particular group of plants (fungi, algae or flower plants) to facilitate their use in technological processes associated with biomass conversion into bioenergy, biofuels or biomaterials.


Partners

  1. National:
    • Polish Academy of Sciences Institute of Biochemistry and Biophysics in Warsaw
    • Jagiellonian University in Cracow
    • University of Life Sciences in Lublin
    • National Research Institute of Animal Production in Balice near Cracow
  2. International:


Grants
none for the moment



Powrót »